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抗体通常用来标记膜蛋白,但抗体在标记时有些限制,大尺寸容易增加定位的不准确度。我们用抑制剂探针标记细胞顶膜表面(图a)和基底膜表面的PSMA,同时与抗体做了比较(图b)。我们首先比较了两种探针的标记密度,结果显示,对于顶膜表面来说,抑制剂探针单位面积的标记密度达到2306 ± 152 μm-2,抗体只有1902 ± 102 μm-2,对于基底膜表面来说,这两种探针的标记密度差异达到801 μm-2,表明抑制剂探针能提供更好密度的PSMA识别能力,尤其对于细胞膜基底膜表面的PSMA,抗体存在不完全标记现象(图c)。除此之外,SR-Tesseler的方法也用来提取这两种探针识别的簇信息。无论顶膜表面还是基底膜表面,单位面积内抗体识别的簇都要比抑制剂至少少一个(图d),除此之外,通过比较两种探针识别的簇面积,我们发现,对于顶膜表面来说,抑制剂识别的簇面积要小于抗体,说明在饱和标记的情况下,抑制剂探针识别的簇要小于抗体;而在基底膜表面,抑制剂探针识别的簇面积大约是抗体的2倍,说明抑制剂的小尺寸使其比抗体更容易结合细胞膜基底膜表面的PSMA(图e)。
以上结果表明了抑制剂探针具有更准确的蛋白识别能力。传统的抗体尺寸比较大,并且为多价态,在识别膜表面的蛋白时,容易导致交联和潜在空间位阻,相比较而言,抑制剂探针尺寸较小,为单价态,这些特征使其以高精度定位蛋白。因此,抑制剂探针可以识别更多的PSMA并且能更好的区分临近的簇。
如图 抑制剂探针和抗体探针标记的区别。抑制剂探针和抗体对细胞顶膜表面(a)和基底膜表面(b)PSMA的超分辨成像。标尺为5 μm。(c-e)对抑制剂探针和抗体标记的超分辨图像的定量分析:每平方微米的定位数(c)、簇个数(d)和平均簇面积(e)。